香田将英の個人サイト。公衆衛生・メンタルヘルスの研究と、R・データ分析・生成AIなどの覚書を掲載しています。https://shoei05.com/jahttps://shoei05.com/articles/3001/https://shoei05.com/articles/3001/日本の公的統計を使った研究論文を、テーマ、データ源、解析データの年から探せるサイトの紹介。紹介動画、収載範囲、使い方、分類の方法と注意点をまとめました。Sat, 07 Nov 2026 06:30:00 GMThttps://shoei05.com/articles/168383909/https://shoei05.com/articles/168383909/Gemini Notebook（旧NotebookLM）をターミナルから操作する「notebooklm」スキルの紹介。インストール手順とコマンド例を掲載しています。Sat, 04 Jul 2026 00:24:38 GMThttps://shoei05.com/articles/147178717/https://shoei05.com/articles/147178717/講演「臨床の質を上げる生成AI活用」の動画を公開し、医療現場での安全な活用や講演の内容、配布資料の入手方法を紹介します。Mon, 16 Feb 2026 13:26:45 GMThttps://shoei05.com/articles/146374322/https://shoei05.com/articles/146374322/研究費の申請書を準備する段階で、研究の着想を広げ、関連文献をもとに検討を絞り込むための2つの生成AIエージェントを紹介します。Wed, 11 Feb 2026 05:14:04 GMThttps://shoei05.com/articles/146370319/https://shoei05.com/articles/146370319/水本篤さんの英語論文執筆ガイドを起点に、生成AIを使う際の文献確認や、論文を書く前の着想・研究計画の段階で生じる倫理的な課題を考えます。Wed, 11 Feb 2026 04:45:40 GMThttps://shoei05.com/articles/142801125/https://shoei05.com/articles/142801125/Geminiで臨床疑問を調べ、参照文献を確認するためのカスタムGem「Clinical Evidence Mapper」と、設定に使う指示文を公開します。Sat, 17 Jan 2026 19:45:41 GMThttps://shoei05.com/articles/2898/https://shoei05.com/articles/2898/前回の記事で、私は「システマティックレビューとメタ解析に基づき、GRADEシステムに沿って包括的に解説」するようなプロンプトを紹介しました。Sun, 23 Nov 2025 04:15:23 GMThttps://shoei05.com/articles/128265593/https://shoei05.com/articles/128265593/医療現場で生成AIを使うとき、学習をオフにする設定だけでは足りない場合を、紹介状や会議録の事例とガイドラインに沿って解説します。Wed, 01 Oct 2025 22:10:36 GMThttps://shoei05.com/articles/2890/https://shoei05.com/articles/2890/公開したChrome拡張機能「OpenEvidence Search Helper」の機能として、システマティックレビューの優先、GRADEの評価案、日本語入力中の誤送信防止を紹介します。Wed, 10 Sep 2025 12:36:26 GMThttps://shoei05.com/articles/124911743/https://shoei05.com/articles/124911743/臨床的な疑問を調べるときのUpToDateと検索AIの使い分けを整理し、レビューを優先して探すためのOpenEvidence用Chrome拡張を紹介します。Fri, 05 Sep 2025 12:27:09 GMThttps://shoei05.com/articles/2864/https://shoei05.com/articles/2864/医療情報検索AIのOpenEvidenceを使いやすくするChrome拡張機能を紹介し、システマティックレビューを優先する理由と、拡張機能を手動でインストールする手順を説明します。Thu, 04 Sep 2025 22:23:53 GMThttps://shoei05.com/articles/123095586/https://shoei05.com/articles/123095586/医学教育で「検証してから信頼する」をどう教えるか。NEJMの医学教育シリーズをもとに、臨床で生成AIの出力を吟味する方法を紹介します。Fri, 22 Aug 2025 02:44:55 GMThttps://shoei05.com/articles/111903763/https://shoei05.com/articles/111903763/医療・教育で生成AIを使うときの注意点を整理し、OpenEvidenceの使い方や講演動画を紹介します。Mon, 05 May 2025 03:05:52 GMThttps://shoei05.com/articles/2846/https://shoei05.com/articles/2846/教育機関で画像生成AIを使う際の参考資料。著作権上の表現とアイデアの区別、教育目的の例外、倫理面の注意を整理します。Sun, 30 Mar 2025 09:28:18 GMThttps://shoei05.com/articles/2836/https://shoei05.com/articles/2836/本記事は、Lee (2025)らの「生成AIの批判的思考への影響: 知識労働者の調査による自己申告された認知努力の軽減と自信の効果」に基づく大学教員向けの解説です。Thu, 13 Mar 2025 05:31:20 GMThttps://shoei05.com/articles/2706/https://shoei05.com/articles/2706/研究者向けにZotero 7の導入手順をまとめ、文献をブラウザから取り込む方法、PDFを外部ストレージに置く設定、引用キーの管理や翻訳に使う拡張機能を紹介します。Fri, 03 Jan 2025 09:52:04 GMThttps://shoei05.com/articles/2663/https://shoei05.com/articles/2663/RStudioでQuartoを使い始めるときの覚書として、ドキュメントの基本設定、VisualモードとSourceモードの切り替え、Rのコードチャンクの挿入方法を紹介します。Sat, 15 Jun 2024 12:29:52 GMThttps://shoei05.com/articles/2610/https://shoei05.com/articles/2610/医療現場における当直表作成は、複雑な制約条件とスタッフの希望を両立させる必要があり、担当者にとって大きな負担となっています。Tue, 28 May 2024 09:00:00 GMThttps://shoei05.com/articles/2546/https://shoei05.com/articles/2546/音声データを文字起こしする際、ノイズや音量のばらつきは悩みの種ですよね。特に大量のファイル処理には、事前準備が欠かせません。Sun, 26 May 2024 03:05:01 GMThttps://shoei05.com/articles/2518/https://shoei05.com/articles/2518/音声認識で議事録作成は楽になったけど、誤字の修正が面倒くさい… 特に、人名や専門用語などを毎回修正するのは本当に大変ですよね。Sat, 25 May 2024 14:09:35 GMThttps://shoei05.com/articles/2461/https://shoei05.com/articles/2461/このPHPバージョンアップに伴い、主にバーチャルホスト機能（http://アカウント.umin.jp/など）を使用している方を中心に、ウェブサイトが表示されなくなった方々を散見します。これまでの事例から現状での対応方法をまとめてみました。Tue, 27 Feb 2024 05:05:03 GMThttps://shoei05.com/articles/2452/https://shoei05.com/articles/2452/『医学生・医師のライフキャリアワークブック』を読み、本人の自己決定を尊重するキャリア教育、教員の倫理、健康の社会的決定要因への対応と燃え尽きについて考えます。Mon, 12 Feb 2024 02:35:15 GMThttps://shoei05.com/articles/2430/https://shoei05.com/articles/2430/このメッセージは心理的応急処置 (PFA: psychological first aid, サイコロジカルファーストエイド) 並びに国連が提唱する精神保健及び心理社会的支援 (MHPSS: Mental health and psych…Wed, 03 Jan 2024 04:35:21 GMThttps://shoei05.com/articles/2418/https://shoei05.com/articles/2418/JAMA Network Open に Research Letter が掲載されました。 2022年1月から自死理由の集計方法が変更されたことを受けて、実際にどのくらいの影響が出ているかについて調べました。Fri, 15 Dec 2023 23:28:39 GMThttps://shoei05.com/articles/2342/https://shoei05.com/articles/2342/学術論文の執筆は研究者にとって重要なプロセスであり、自分の研究成果を世界に発信する手段となります。しかし、論文が学術誌に掲載されるまでの道のりは、多くの場合、査読や修正が繰り返される長いものです。Sun, 23 Apr 2023 01:53:50 GMThttps://shoei05.com/articles/2293/https://shoei05.com/articles/2293/2023年1月24日、Nature誌は論文執筆にAIのChatGPTを使用することに関して規制を設けると発表しました 。この発表を皮切りに、AI と 論文執筆の適切な関係性について様々な意見が飛び交っています 。Sat, 18 Feb 2023 10:05:48 GMThttps://shoei05.com/articles/2258/https://shoei05.com/articles/2258/今週号の医学界新聞に寄稿が掲載されました。先日、PCNに受理された論文についてKazu先生(@peacewaffle )と対談形式で論文執筆の過程を振り返っています。Mon, 06 Jun 2022 12:08:11 GMThttps://shoei05.com/articles/2099/https://shoei05.com/articles/2099/先日、いりとあきいさ先生の一連の精神科後期研修のおすすめ書籍をまとめたページを作成しました。Sun, 06 Jun 2021 06:00:30 GMThttps://shoei05.com/articles/2015/https://shoei05.com/articles/2015/COVID-19感染症の流行で、学術大会や研究会でオンライン開催が増えています。音声動画データの提出が求められることがあり、「 .mp4、 500 MB 以内 で作成してください」といった指定が入ることもあります。Mon, 03 May 2021 22:43:22 GMThttps://shoei05.com/articles/1965/https://shoei05.com/articles/1965/限られた時間で全体を把握する目的と、現在のトピックを縦断的に把握する目的で、一つテーマを決めて関連した論文の見出しと Abstract を日本語に翻訳しています。Mon, 05 Apr 2021 23:13:51 GMThttps://shoei05.com/articles/1959/https://shoei05.com/articles/1959/限られた時間で全体を把握する目的と、現在のトピックを横断的に把握する目的で、オープンアクセスである日本疫学会誌 Journal of Epidemiology の見出しと Abstract を日本語に翻訳しています。Mon, 05 Apr 2021 21:50:45 GMThttps://shoei05.com/articles/1868/https://shoei05.com/articles/1868/連載「臨床医のための疫学シリーズ」と医学における因果推論の総説へのリンクを整理し、疫学用語、研究仮説とDAG、バイアス、統計学の役割を学べる資料を紹介します。Thu, 11 Mar 2021 23:15:34 GMThttps://shoei05.com/articles/1838/https://shoei05.com/articles/1838/いりとあきいさ先生が紹介した精神科後期研修の書籍を、初診・診断面接、症候学・精神病理、精神薬理などの分野別に整理し、研修中に読みたい本を探せるようにしました。Wed, 10 Mar 2021 16:42:26 GMThttps://shoei05.com/articles/943/https://shoei05.com/articles/943/キーラン・ヒーリーの『データ分析のためのデータ可視化入門』を読み、Rで図を描く手順に加えて、可視化の考え方をどう学べるかを、地理空間データの章にも触れながら紹介します。Sat, 20 Feb 2021 20:58:45 GMThttps://shoei05.com/articles/816/https://shoei05.com/articles/816/Rstudio 1.4 になって、visual markdown editor を使って、Zoteroから簡単に文献を引用できるようになりました。Mon, 25 Jan 2021 07:34:47 GMThttps://shoei05.com/articles/794/https://shoei05.com/articles/794/Rstudio 1.4 がリリースされ、Docker内でも使えるようになりました。1.4 ではvisual markdown editor が特徴的です。Thu, 21 Jan 2021 23:00:55 GMThttps://shoei05.com/articles/606/https://shoei05.com/articles/606/限られた時間で全体を把握する目的と、現在のトピックを横断的に把握する目的で、オープンアクセスである日本疫学会誌 Journal of Epidemiology の見出しと Abstract を日本語に翻訳しています。Mon, 18 Jan 2021 22:19:23 GMThttps://shoei05.com/articles/482/https://shoei05.com/articles/482/Rstudio のエディタ（Sourceペイン）に関して、一番左のタブのエディタでは、日本語入力が確定する前は表示されないという事象が起こっていました。Sat, 02 Jan 2021 18:42:09 GMThttps://shoei05.com/articles/370/https://shoei05.com/articles/370/データラングリングや可視化、分析をするためにRを操作していると、以前書いたコードを忘れて、調べるたびに同じ頁に行き着くことがあります。一定回数以上「あれ、どうだったっけな？」と思って調べた小技について、随時掲載していきます。Thu, 31 Dec 2020 18:12:42 GMThttps://shoei05.com/articles/274/https://shoei05.com/articles/274/治療・療養中の人たちの支えとなるのは、その人にとって大事な家族やパートナーの存在であると考えます。もちろん、家族やパートナーの方々にとっても同じことでしょう。Sat, 05 Dec 2020 08:06:53 GMThttps://shoei05.com/articles/255/https://shoei05.com/articles/255/Rstudio を使っていると Dropbox が常に同期状態となっていることがあります。 Rstudio 内のプロジェクトファイル監視機能と、 Git の一時ファイルが競合しているようです。Sat, 05 Dec 2020 03:46:43 GMThttps://shoei05.com/articles/239/https://shoei05.com/articles/239/Rmarkdown (.Rmd)ファイルをサブディレクトリで管理していると、外部ファイルへのパス指定で戸惑うことがあります。デフォルトでは、Rチャンク（chunk）の作業ディレクトリは、.Rmdファイルのあるディレクトリになります。Mon, 02 Nov 2020 12:15:15 GMThttps://shoei05.com/articles/206/https://shoei05.com/articles/206/文献管理ソフトは、私は Zotero を使っています。理由は色々あるのですが、一言でいえば、無料で使えて拡張性があり、急に今使っているマシンが壊れても設定次第ですぐに代替機で復旧できるところが大きいです。Fri, 30 Oct 2020 16:24:58 GMThttps://shoei05.com/articles/196/https://shoei05.com/articles/196/前回、Docker で Rstudio を起動する記事を書きました。そのままでも問題ないのですが、Docker run する際に、毎回長いコードを書くのも覚えるのも大変です。Fri, 30 Oct 2020 14:20:51 GMThttps://shoei05.com/articles/165/https://shoei05.com/articles/165/Rstudioを使うにあたり整理方法を決めておかないと、プロジェクトが増えれば増えるほど、どのスクリプトが最新で、どのような内容で、そこで生成したファイルがどこにいったのか、わからなくなってきます。Sat, 24 Oct 2020 18:32:31 GMThttps://shoei05.com/articles/145/https://shoei05.com/articles/145/Rのスクリプトの冒頭で毎回書く処理をそろえるため、pacmanでパッケージの導入と読み込みをまとめ、作業環境の初期化やメモリ領域の解放を行うコード例を紹介します。Sat, 24 Oct 2020 05:13:09 GMThttps://shoei05.com/articles/56/https://shoei05.com/articles/56/今まで、データ分析にはデスクトップ版のRstudioを使っていたのですが、最近Docker環境下のRstudio Serverに移行しました。Sat, 17 Oct 2020 13:24:32 GMThttps://shoei05.com/articles/6/https://shoei05.com/articles/6/以前（数年前）、UMINサーバーへのMySQL導入について記事にしたことがあったのですが、色々いじっていたら動かなくなってしまい、しばらく放置していました。Tue, 13 Oct 2020 02:11:51 GMT